Analiza białek 1200-Bt11AB-SD
Wykład (WYK) Semestr zimowy 2018/19

1. Ćwiczenia z biochemii, Kłyszejko-Stefanowicz (red.), wyd. 1, 2005, PWN Warszawa.

2. Biochemia, Berg, Tymoczko, Stryer , wyd 4 zm., 2009, PWN Warszawa.

3. Principles and techniques in biochemistry and molecular biology, Wilson K. Walker J., ed., Oxford University Press, 2005.

4. Crowley T.E., Kyte J. Experiments in the purification and characterization of enzymes. A laboratory manual. Academic Press, Elsevier, 2014. (podręcznik dostępny w ZBiBK)

W01 - student potrafi zidentyfikować i opisać omawiane grupy białek

W02 - ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem metod i narzędzi badawczych stosowanych w badaniach białek

W03 – ma wiedzę na temat wykorzystania białek w biotechnologii

K01 - Student jest świadom dynamicznego rozwoju nauki w dziedzinie analizy białek i rozumie potrzebę aktualizacji wiedzy na podstawie najnowszej literatury

Egzamin pisemny (uzyskanie punktów w ilości 0-50% - ocena niedostateczna; 51-60% - ocena dostateczna; 61-70% - ocena dostateczna plus; 71-80%- ocena dobra; 81-90% - ocena dobra plus: 91-100% - ocena bardzo dobra)

1. Metody izolacji struktur komórkowych: frakcjonowanie komórki, izolowanie organelli i podstruktur komórkowych, identyfikacja struktur komórkowych;

2. Metody uwalniania białek z komórek zwierzęcych i roślinnych: metody enzymatyczne, fizyczne i chemiczne;

3. Oczyszczanie białek z lizatów komórkowych: metody chromatograficzne, wysalanie, ultrawirowanie;

4. Elektroforetyczne metody analizy białek: elektroforeza denaturująca, elektroforeza natywna, Western-blot, Far Western blot;

5. Analizy sekwencji i masy cząsteczkowej: sekwencjonowanie polipeptydów, porównywanie sekwencji, wirowanie analityczne, spektrometria mas;

6. Analizy struktury drugorzędowej: dichroizm kołowy, kalorymetria różnicowa, ograniczona proteoliza;

7. Analizy struktury trzeciorzędowej: rentgenografia strukturalna, NMR;

8. Nowoczesne metody dynamicznego badania białek w komórce: śledzenie lokalizacji i przemieszczania białka w komórce; identyfikacja partnerów oddziałujących z białkiem;

9. Elementy proteomiki: metoda „pull out”, elektroforeza dwukierunkowa, identyfikacja cząsteczek metodą trypsynolizy i spektrometrii mas;

10. Podstawy produkcji białek rekombinowanych;

11. Analiza białek w biotechnologii – markery i enzymy.