Uniwersytet Kazimierza Wielkiego - Centralny System Uwierzytelniania

NA SKRÓTY
STUDENCI, PRACOWNICY
JEDNOSTKI ORGANIZACYJNE
PRZEDMIOTY
- Bioinformatyka
  - Semestr zimowy 2019/20 - Laboratorium (LAB)
STUDIA
AKADEMIKI
POMOC

Bioinformatyka 1200-B23Bin-SD
Laboratorium (LAB) Semestr zimowy 2019/20

Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)

Liczba godzin:	30
Limit miejsc:	(brak limitu)
Zaliczenie:	Zaliczenie na ocenę
Rygory zaliczenia zajęć:	zaliczenie na ocenę
Literatura uzupelniająca:	National Center for Biotechnology Information http://www.ncbi.nlm.nih.gov European Bioinformatics Institute http://www.ebi.ac.uk ExPASy Proteomics Server http://expasy.org/ Molecular Evolutionary Genetics Analysis http://www.megasoftware.net/
Metody dydaktyczne:	ćwiczenia konwersatoryjne warsztaty wykład konwersatoryjny
Metody dydaktyczne - inne:	Praca indywidualna: samodzielna analiza sekwencji w oparciu o przedyskutowane w trakcie zajęć przykłady
Literatura:	Xiong J. Podstawy bioinformatyki, Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 2011.
Efekty uczenia się:	[K-W03] W01 - Zna adekwatne do problemu źródła danych biologicznych W02 - Objaśnia metodologię modelowania homologicznego i opisuje poszczególne jej etapy [K_W04] W03 - Objaśnia podstawowe mechanizmy ewolucji molekularnej [K_U03] U01 - Korzysta z publicznie dostępnych baz danych biologicznych U02 - Przeprowadza porównania sekwencji w celu poszukiwania funkcji genów U03 - Posługuje się danymi sekwencji w analizie filogenetycznej U04 - Umiejętnie i właściwie stosuje metody bioinformatyczne w projektowaniu eksperymentów [K_K02] K01 - Jest świadomy, w jaki sposób rozpowszechniane są wyniki najnowszych badań z zakresu biologii molekularnej K02 - Posiada nawyk korzystania z literatury i danych udostępnianych przez internetowe bazy danych K03 - Jest kreatywny i przygotowany do prezentacji pracy magisterskiej
Metody i kryteria oceniania:	Sprawozdania z zajęć. Pisemne kolokwium zaliczeniowe w formie testu.
Zakres tematów:	Wprowadzenie do bioinformatyki. Biologiczne bazy danych on-line i wyszukiwanie w nich informacji. Alignment sekwencji. Poszukiwanie podobieństwa w bazach danych. Identyfikacja motywów i domen w sekwencjach. Rekonstrukcja ewolucji sekwencji. Filogenetyka molekularna.

Grupy zajęciowe

zobacz na planie zajęć

Grupa	Termin(y)	Prowadzący	Miejsca Liczba osób w grupie / limit miejsc	Akcje
1	każdy poniedziałek, 9:15 - 10:45, sala 7 (PK)	Andrzej Oleksa, Sandra Jankowska-Wróblewska	4/4	szczegóły
Wszystkie zajęcia odbywają się w budynku: Budynek F przy ul. Chodkiewicza

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Kazimierza Wielkiego.