Uniwersytet Kazimierza Wielkiego - Centralny System Uwierzytelniania

NA SKRÓTY
STUDENCI, PRACOWNICY
JEDNOSTKI ORGANIZACYJNE
PRZEDMIOTY
- Bioinformatyka
  - Semestr Letni 2023/24 - Laboratorium (LAB)
STUDIA
AKADEMIKI
POMOC

Bioinformatyka 1200-BT36B-SP
Laboratorium (LAB) Semestr Letni 2023/24

Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)

Liczba godzin:	30
Limit miejsc:	(brak limitu)
Zaliczenie:	Zaliczenie na ocenę
Rygory zaliczenia zajęć:	zaliczenie na ocenę
Literatura uzupelniająca:	- National Center for Biotechnology Information http://www.ncbi.nlm.nih.gov - European Bioinformatics Institute http://www.ebi.ac.uk -ExPASy Proteomics Server http://expasy.org/ - Molecular Evolutionary Genetics Analysis http://www.megasoftware.net/
Metody dydaktyczne:	ćwiczenia laboratoryjne
Metody dydaktyczne - inne:	Analiza danych bioinformatycznych pochodzących z ogólnodostępnych baz danych z wykorzystaniem szerokiego wachlarza programów komputerowych (w ramach pracowni komputerowej)
Literatura:	- Xiong J. Podstawy bioinformatyki, Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 2009 Higgs P. G., Attwood T. K., Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2008 - Baxevanis A. D., Ouellette B. F. F., Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2004 - Węgleński P., Genetyka molekularna, PWN, Warszawa 2006
Efekty uczenia się:	W.01, W.02, W.03, W.04, U0.1,U.02, U.03, K0.1,K.02, K.03
Metody i kryteria oceniania:	Obecność i aktywne uczestnictwo w zajęciach Samodzielna praca zaliczeniowa + Kolokwium końcowe w formie testu jednokrotnego wyboru+ pytania otarte System oceniania - zakresy punktowe: Od 60% pozytywnych odpowiedzi - ocena dostateczna; Od 70% pozytywnych odpowiedzi - ocena dostateczna plus; Od 80% pozytywnych odpowiedzi - ocena dobra; Od 90% pozytywnych odpowiedzi - ocena dobra plus; Od 95% pozytywnych odpowiedzi - ocena bardzo dobra
Zakres tematów:	1. Wprowadzenie do bioinformatyki 2. Bazy bibliograficzne on-line 3. Wykorzystanie SI 4. Metody sekwencjonowania NGS i TGS 5. Biologiczne bazy danych 6. Algorytmy bioinformatyczne 7. Dopasowywanie sekwencji i poszukiwanie podobieństwa w bazach danych 8. Możliwości wykorzystywania markerów genetycznych w praktyce 9. Filogenetyka molekularna 10. Anotacje 11. Przewidywanie struktur białek.

Grupy zajęciowe

zobacz na planie zajęć

Grupa	Termin(y)	Prowadzący	Miejsca Liczba osób w grupie / limit miejsc	Akcje
1	każdy wtorek, 15:00 - 16:30, sala 7 (PK)	Bartosz Ulaszewski	11/10	szczegóły
Wszystkie zajęcia odbywają się w budynku: Budynek F przy ul. Chodkiewicza

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Kazimierza Wielkiego.