Uniwersytet Kazimierza Wielkiego - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Analiza białek 1200-Bt11AB-SD
Wykład (WYK) Semestr zimowy 2023/24

Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)

Liczba godzin: 30
Limit miejsc: (brak limitu)
Zaliczenie: Egzamin
Rygory zaliczenia zajęć: egzamin
Literatura uzupelniająca: http://www.piercenet.com/
http://www.enzim.hu/~szia/cddemo/edemo0.htm
http://www.youtube.com/watch?v=J-wao0O0_qM
http://www.uniprot.org
Protein Data Bank (PDB)
Cambridge Structural Database (CSD)
Inorganic Crystal Structure Database (ICSD)
Biological Macromolecule Crystallization Database (BMCD)
UniProt
Nuc P., Nuc K. (2006) Produkcja białek rekombinowanych. Post. Bioch. 52, 448.

Śliwinska M, Robaszkiewicz K, Czajkowska M, Zheng W, Moraczewska J. (2018) Functional effects of substitutions I92T and V95A in actin-binding period 3 of tropomyosin. Biochim Biophys Acta Proteins Proteom. 2018 Apr;1866(4):558-568

Małgorzata Śliwinska, Katarzyna Robaszkiewicz, Piotr Wasąg, Joanna Moraczewska (2021) Mutations Q93H and E97K in TPM2 Disrupt Ca-Dependent Regulation of Actin Filaments. International Journal of Molecular Sciences - 2021, Vol. 22, iss. 8, art. no 4036

Joanna Moraczewska (2018). Filamenty cienkie i mikrofilamenty - funkcjonalne kompleksy aktyny z tropomiozyną. Kosmos, T. 67, nr 1, s. 31-41


Metody dydaktyczne: wykład kursowy
Metody dydaktyczne - inne: prezentacje multimedialne
Literatura:

1. Ćwiczenia z biochemii, Kłyszejko-Stefanowicz (red.), wyd. 1, 2005, PWN Warszawa.

2. Biochemia, Berg, Tymoczko, Stryer , wyd 4 zm., 2009, PWN Warszawa.

4. Principles and techniques in biochemistry and molecular biology, Wilson K. Walker J., ed., Oxford University Press, 2005.

5. Crowley T.E., Kyte J. Experiments in the purification and characterization of enzymes. A laboratory manual. Academic Press, Elsevier, 2014.

Efekty uczenia się:

W02 - ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem metod i narzędzi badawczych stosowanych w badaniach białek

W03 – ma wiedzę na temat wykorzystania białek w biotechnologii

K01 - Student jest świadom dynamicznego rozwoju nauki w dziedzinie analiz białek i rozumie potrzebę aktualizacji wiedzy na podstawie najnowszej literatury

Metody i kryteria oceniania:

Egzamin pisemny (uzyskanie punktów w ilości 0-50% - ocena niedostateczna; 51-60% - ocena dostateczna; 61-70% - ocena dostateczna plus; 71-80%- ocena dobra; 81-90% - ocena dobra plus: 91-100% - ocena bardzo dobra)

Zakres tematów:

1. Metody izolacji struktur komórkowych: frakcjonowanie komórki, izolowanie organelli i podstruktur komórkowych, identyfikacja struktur komórkowych;

2. Metody uwalniania białek z komórek zwierzęcych i roślinnych: metody enzymatyczne, fizyczne i chemiczne;

3. Oczyszczanie białek z lizatów komórkowych: metody chromatograficzne, wysalanie, ultrawirowanie;

4. Elektroforetyczne metody analizy białek: elektroforeza denaturująca, elektroforeza natywna, Western-blot, Far Western blot;

5. Analizy sekwencji i masy cząsteczkowej: sekwencjonowanie polipeptydów, porównywanie sekwencji, wirowanie analityczne, spektrometria mas;

6. Analizy struktury drugorzędowej: dichroizm kołowy, kalorymetria różnicowa, ograniczona proteoliza;

7. Analizy struktury trzeciorzędowej: rentgenografia strukturalna, NMR;

8. Nowoczesne metody dynamicznego badania białek w komórce: śledzenie lokalizacji i przemieszczania białka w komórce; identyfikacja partnerów oddziałujących z białkiem;

9. Elementy proteomiki: metoda „pull out”, elektroforeza dwukierunkowa, identyfikacja cząsteczek metodą trypsynolizy i spektrometrii mas;

10. Podstawy produkcji białek rekombinowanych;

11. Analiza białek w biotechnologii – markery i enzymy.

Grupy zajęciowe

zobacz na planie zajęć

Grupa Termin(y) Prowadzący Miejsca Liczba osób w grupie / limit miejsc Akcje
1 jednokrotnie, czwartek (konkretny dzień, zobacz opis przedmiotu), 8:00 - 9:30, Budynek przy ulicy Poniatowskiego, sala 108
każdy piątek, 15:00 - 16:30, (budynek nieznany), (sala nieznana)
wielokrotnie, czwartek (niestandardowa częstotliwość), 8:00 - 9:30, Budynek przy ulicy Poniatowskiego, sala 3
Małgorzata Siatkowska 6/12 szczegóły
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Kazimierza Wielkiego.
J.K. Chodkiewicza 30
85-064 Bydgoszcz
tel: +48 52 32 66 429 https://ukw.edu.pl
kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.3.0-1 (2024-04-02)